南京的医学考研院校包括：
南京医科大学：
南京医科大学是江苏省属重点建设高校，创建于1934年，时名江苏省立医政学院。1957年迁至南京，更名为南京医学院，1981年被批准为全国首批博士、硕士学位授予单位，1993年更名为南京医科大学。学校在公共卫生与预防医学、临床医学、口腔医学等领域具有显著优势，其中公共卫生与预防医学在全国第四轮学科评估中获评A+等级。
南京大学医学院：
南京大学医学院是南京大学的一个学院，虽然其主体专业涵盖了生物学、化学等，但也包含医学领域的相关专业。南京大学医学院在基础医学和临床医学方面都有较高的研究水平。
南京中医药大学：
南京中医药大学是以中医药为特色的高等学府，其在中医药领域有着深厚的积累和丰富的教育资源。学校不仅提供中医药的本科教育，还涉及中医临床、针灸推拿等多元化的专业方向。
这些学校在医学领域都有较高的声誉和影响力，提供了丰富的医学教育和研究资源，是医学考研的不错选择。建议根据自己的兴趣和专业方向，选择合适的院校进行报考。