清华大学自动化专业考研科目包括 数学、英语、政治和专业课。其中，政治和英语为全国统考，数学分为数学一、数学二和数学三，而清华大学自动化专业规定必须要考英语一和数学一。
具体到专业课方面，自动化专业的考研科目一般包括：
数学：
包括高等数学、线性代数、概率论与数理统计等。
英语：
包括英语阅读、听力、写作和翻译等。
专业课：
根据报考的方向不同，考试科目也会有所不同。常见的考试科目包括电路理论（包括电路分析、电子技术、信号与系统等）、自动控制原理（包括控制系统分析与设计、现代控制理论等）、计算机基础（包括计算机组成原理、操作系统、数据结构与算法等）以及电磁场与电磁波（包括电磁场理论、电磁波传播与辐射等）。
此外，复试时专业综合考试的内容也会根据不同的研究方向有所差异，例如控制理论与控制工程、检测技术与自动化装置、系统工程、模式识别与智能系统、导航、制导与控制、企业信息化系统与工程、生物信息学等，具体考试内容会包括控制理论（经典控制及现代控制）、电子技术（模拟电子技术、数字电子技术）、运筹学或控制理论、信号与系统等内容。
建议考生在准备考研时，详细查阅清华大学当年的招生简章，了解具体的考试科目和复试要求，以便有针对性地进行复习。