制药工程考研可以选择的专业方向包括：
药学专业：
学习药学学科的基本理论和基本知识，使学生能在药品生产以及检验等领域从事鉴定以及设计等工作。
化学工程与技术专业：
旨在培养化学工业领域的装置设计以及企业经营管理的方面的高素质人才。
中药学专业：
学生主要学习的是中药学的基本理论和知识，具备中药鉴定、中药制备以及中药炮制的基本能力。
药物化学专业：
培养能在科研与开发生产领域从事药物合成、药物设计和功能基因药物的研究，药品监督和管理的高级专业人才。
药理学专业：
研究药物与机体间相互作用规律及其药物作用机制，包括药效动力学和药代动力学两个方面。
药剂学专业：
研究药物制剂剂型的基本理论、处方设计、生产工艺、合理应用以及药物制剂剂型和药物的吸收、分布、代谢及排泄关系的综合技术科学。
药事管理专业：
涉及药品的注册、生产、流通、使用等环节的管理与监督。
微生物与生化药学专业：
研究微生物与生化药物的基本理论和应用。
天然药化专业：
研究天然药物的成分、结构、生物活性和制剂技术。
生药学专业：
研究药用植物、动物和矿物的来源、鉴定、性状、成分、功效及应用等。
这些专业方向涵盖了制药工程的多个方面，包括药物的研发、生产、质量控制、管理等方面。建议根据个人兴趣和职业规划选择合适的专业进行深入研究。例如，对药物研发感兴趣的学生可以选择药物化学或药理学专业；对药品生产和管理感兴趣的学生可以选择化学工程与技术或药事管理专业；对中医药感兴趣的学生可以选择中药学专业。