考研的主管部门是教育部学位管理与研究生教育司。该部门主要负责组织实施《中华人民共和国学位条例》，拟订全国学位与研究生教育工作的改革与发展规划，指导与管理研究生培养工作，指导学科建设与管理工作，以及承担“世界一流大学和一流学科建设”等项目的实施和协调工作。
各个高校通常设有自己的研究生考试办公室（研招办），负责本校的研究生招生工作，包括确定录取人数、推免人数、专业课命题和复试等，并需上报教育主管部门批准。公共课考试通常由国家统一组织，而专业课考试则大部分学校独立命题。
考生可以根据自己的情况选择报考点，应届本科毕业生原则上应选择就读学校所在省区市的报考点办理相关业务