制药工程专业的考研目标专业主要包括以下几种：
药学专业：
药学专业主要学习药学学科的基本理论和基本知识，使学生能在药品生产、检验等领域从事鉴定、设计等工作。
中药学专业：
中药学专业培养具备中药学基础理论、基本知识、基本技能以及与其相关的中医学、药学等方面的知识和能力，能在中药生产、检验、流通、使用和研究与开发领域从事中药鉴定、设计、制剂及临床合理用药等方面工作。
微生物与生化药学专业：
该专业涉及微生物和生化药物的研究，适合对生物化学和微生物学有浓厚兴趣的学生。
药理学专业：
药理学是研究药物与机体间相互作用规律及其药物作用机制的一门科学，主要包括药效动力学和药代动力学两个方面，适合对药物作用机制感兴趣的考生。
药剂学专业：
药剂学是研究药物制剂剂型的基本理论、处方设计、生产工艺、合理应用以及药物制剂剂型和药物的吸收、分布、代谢及排泄关系的综合技术科学，适合对药物制备和应用感兴趣的考生。
药事管理专业：
药事管理专业涉及药品的注册、生产、流通、使用等环节的管理，适合对药品管理感兴趣的学生。
发酵工程专业：
发酵工程是利用微生物进行工业生产的技术，适合对生物技术和发酵过程感兴趣的学生。
化学工程专业：
化学工程与技术专业涵盖了化学工业领域的装置设计、生产、经营等方面，适合对化学工程感兴趣的学生。
生物制药专业：
生物制药是利用生物技术手段制备药物，包括基因工程药物、生物制品等，适合对生物技术感兴趣的学生。
建议学生在选择考研专业时，结合自己的兴趣和职业规划，综合考虑各个专业的课程设置、就业前景以及个人发展需求，选择最适合自己的方向。