签就业协议并不影响你参加考研。就业协议与劳动合同不同，它主要是为了明确毕业生、用人单位和学校在就业过程中的权利和义务，并不限制个人选择继续深造的权利。如果你已经签订了三方就业协议，想要考研，通常需要遵循以下步骤：
查看协议条款：
首先，你需要仔细阅读三方就业协议中的条款，查看是否有关于考研或解除协议的特别规定。
与单位协商：
如果你决定考研，需要与签订三方协议的用人单位进行沟通，诚恳地说明你的目的，并尽量协商解除劳动关系。
支付违约金：
如果协议中有关于违约金的条款，你可能需要按照协议支付相应的违约金。
档案转移：
考上研究生后，通常需要学校出具调档函，将你的档案从原单位转移到学校。
法律依据：
根据相关法律规定，考研属于个人选择，不受之前签订的就业协议的限制。
请确保在做出决定前，你已经充分考虑了所有可能的法律和道德后果，并尽可能与用人单位进行友好协商。