重庆自动化专业考研科目包括以下几部分：
公共课科目
政治：全国统考科目，主要考察时事政治和政治基础知识。
英语：全国统考科目，难度介于四六级之间，接近六级水平，主要考察阅读理解、翻译和写作能力。
数学一：全国统考科目，包括微积分、线性代数、数理统计与概率论等内容，是自动化专业考研中的重点和难点。
专业课科目
自动控制原理二：这是自动化专业的主要专业课之一，涉及控制理论基础、系统建模、传递函数、稳定性分析等内容。
自动化专业基础综合：可能包括经典控制理论、嵌入式技术、电子设计自动化应用技术、运动控制、计算机控制技术等。
复变函数与常微分方程：这是一门基础课程，在复试中可能会作为任选一门考试科目。
专业外语翻译：主要考察考生的专业外语翻译能力。
专业综合面试：主要考察考生的综合素质、思考分析能力、语言组织及表达能力、临场应变能力等。
复试科目
外语听力、口语：考察考生的英语交流沟通能力和应用能力。
任选一门自动化专业基础综合考试：如经典控制理论、嵌入式技术、电子设计自动化应用技术、运动控制、计算机控制技术等。
建议考生在准备考研时，要重点复习公共课科目，同时也要认真学习和掌握专业课的相关知识，以应对考试中的各种挑战。