南航（南京航空航天大学）和重大（重庆大学）都是国内知名的学校，考研难度都相对较高，但各有其优势。以下是一些关键点的比较：
学校层次
重大：985高校，整体实力较强，学校牌子显著，就业前景较好，尤其是工学领域。
南航：211高校，属于国防七子之一，地理位置在南京，控制学科较强。
学科排名
计算机科学与技术：在第四轮学科评估中，重大和南航的计算机科学与技术排名均为B+，整体实力相当，华东理工排名为B。
机械工程：在第四轮学科评估中，重大和南航的机械工程评级均为A-，显示出两校在工科领域的实力。
考研难度
南航：考研难度相对较低，有乱刷人的情况，但如果初试分优势不大，本科背景不太好，可能会被刷。
重大：考研难度也不低，但相对于南航可能稍微容易一些，985高校的平台优势更明显。
地理位置
南航：位于江苏南京，地理位置较为优越，有利于未来在江苏地区发展。
重大：位于山城重庆，虽然地理位置不如上海南京优越，但985高校的品牌效应更为显著。
专业特色
南航：在航空航天、控制工程等领域有较强实力，尤其是飞行器工程。
重大：在机械工程、机器人工程等领域有较强实力，且有多个国家级科研平台。
建议
如果你计划在江苏发展，南航可能是一个更好的选择，因为其地理位置较为优越，且考研难度相对较低。
如果你更看重985高校的平台优势，并且未来希望在工学领域发展，重大可能更适合你，尤其是其计算机科学与技术专业排名较高，且学校整体实力较强。
综合考虑，两所学校各有优势，具体选择还需根据个人职业规划和发展方向来决定。