制药工程考研可以选择以下学校：
北京理工大学
中国科学院大学
南开大学
山西大学
中北大学
辽宁大学
大连理工大学
东北农业大学
苏州大学
南京理工大学
江南大学
江苏大学
南京医科大学
中国药科大学
沈阳药科大学
天津大学
华东理工大学
浙江大学
四川大学
山东大学
南京工业大学
北京化工大学
天津理工大学
河北科技大学
内蒙古工业大学
哈尔滨商业大学
上海医药工业研究院
这些学校中有综合性大学，如浙江大学、四川大学、山东大学，也有专业性的药科大学，如中国药科大学和沈阳药科大学，以及工科背景突出的高校，如天津大学和华东理工大学。建议根据个人兴趣、研究方向和职业规划，选择合适的学校进行报考。