协和毕业的硕士研究生 同时拥有北京协和医学院和清华大学的双重身份。北京协和医学院临床八年制和各专业的研究生均为“清华”和“协和”双身份，这一信息可以从近几年各省定向选调生的招录以及一线城市落户政策中得到验证。尽管清华大学不再另办医学院，而是与原中国协和医科大学逐步整合成为一个医学院，但协和的研究生在就业和继续深造时仍可享受清华大学的教育资源和平台。
此外，协和医学院的研究生在就业市场上具有很高的竞争力。他们通常会受到各大三甲医院的欢迎，并且由于协和医学院的教学质量全国领先，聚集了众多优秀的医学教授和专家，因此这些毕业生在专业素质上会有巨大的提升。
对于学位证书的认可度，虽然合并后的毕业证书上不会直接盖清华大学的印章，而是加盖清华大学医学部的印章，但这并不影响其作为协和医学院毕业生的身份和学位价值。实际上，这些毕业生在求职过程中，其协和医学院的背景往往能够获得雇主的认可和青睐。
综上所述，协和毕业的硕士研究生在学术和职业前景上均具有显著的优势，无论是继续深造还是进入职场，他们都拥有广阔的发展空间和机会。