在996工作制下，在职考研确实面临一些挑战，但通过以下方法可以更好地应对：
选择合适的学校和专业
选择离家近、上课时间灵活、教学质量高的学校和专业，可以减少通勤和上课时间冲突的问题。
合理安排时间
在工作和学习之间合理安排时间，尽量利用午休和晚上的时间进行学习，周末则可以安排更多的学习时间。
合理利用碎片化时间，比如早起半个小时背背单词，上班坐车坐地铁的时候看看网课，午休的时候练一练题目。
寻找学习伙伴
和同样有在职读研需求的同事或朋友一起学习，可以相互帮助和鼓励，也可以分享学习经验和资源。
注重学习效率
制定学习计划，掌握学习方法，选择合适的学习资料，以提高学习效率。
合理安排休息时间
在工作和学习之间，合理安排休息时间，保证身体和心理的健康。
保持积极心态
自信是原动力，要相信自己能够完成考研。
端正态度，有破釜沉舟的决心，不达目的誓不罢休。
抵制诱惑
在职考研可能会面临各种诱惑，如工作、家庭等，要有意识地抵制这些诱惑，全身心投入到复习中。
选择合适的学习方式
可以选择线上课程、视频教程等，利用零碎时间进行学习。
参加考研辅导班，系统学习，提高复习效率。
精挑细选复习资料
参考书和复习资料要精挑细选，选择适合自己的，避免盲目跟风。
制定详细的学习计划
根据自己的实际情况，制定出切实可行的学习计划，并严格按照计划执行。
通过以上方法，可以在996工作制下有效地进行在职考研，最终实现自己的目标。