药学工程考研的好学校有以下几所：
北京大学：
作为国内顶尖高校，北京大学在药学领域具有极高的声誉和实力，是众多学子梦寐以求的目标。
沈阳药科大学：
这所大学在药学领域具有较高的声誉和实力，是药学考研的热门选择之一。
浙江大学：
浙江大学在制药方面表现突出，学科交叉性强，为药学研究提供了广阔的平台。
北京协和医学院：
这所医学院在药学领域具有极高的权威性和影响力，其药学专业在全国高校中名列前茅。
中国药科大学：
中国药科大学是国家“211工程”“985工程优势学科创新平台”和“双一流”建设高校，药学专业实力非常强。
复旦大学：
复旦大学在药学领域也有很高的声誉，是考研的热门院校之一。
上海交通大学：
上海交通大学在制药工程方面表现优异，学科实力强，适合有意向在药学领域深造的学生。
山东大学：
山东大学在药学领域也有很好的表现，学科交叉性强，为药学研究提供了良好的环境。
苏州大学：
苏州大学是江苏的一所211重点建设高校，药学专业考研招生较多，保护第一志愿考生。
南昌大学：
南昌大学是国家双一流建设高校和211工程重点建设高校，药学专业实力较强，招生人数较多。
温州医科大学：
温州医科大学的药理毒理学学科进入ESI全球1%，实力较强，专硕招生多，性价比较高。
华中科技大学：
华中科技大学是国家教育部直属重点综合性大学，学科齐全，实力较强，适合各种背景的学生。
南京医科大学：
南京医科大学在药学领域有很高的声誉，学科实力与整体水平不断提升。
南方医科大学：
南方医科大学在药学领域也有很好的表现，适合有意向在药学领域深造的学生。
这些学校在药学工程领域都有很高的声誉和实力，具体选择哪所学校还需根据个人的兴趣、研究方向和职业规划来决定。建议多了解各学校的招生信息、师资力量和实验室条件等方面，以便做出最适合自己的选择。