医学信息学考研的院校选择可以考虑以下几所：
北京理工大学：
北京理工大学在医学信息工程方面有着较好的教学和研究实力，是一个值得考虑的选项。
哈尔滨工业大学：
哈尔滨工业大学的医学信息工程专业也较为知名，适合对该领域有浓厚兴趣的学生。
上海理工大学：
上海理工大学在医学信息工程领域有一定的教学和研究基础，是一个不错的选择。
深圳大学：
深圳大学在医学信息工程方面也有一定的实力，且地理位置较为优越。
南方医科大学：
南方医科大学在医学信息工程领域有较高的声誉，教学设备先进，师资力量雄厚。
清华大学：
清华大学作为国内顶尖的综合性大学，其医学信息工程专业设立较早，师资力量雄厚，教学设备齐全，且有很好的科研成果和国际合作项目。
北京航空航天大学：
北京航空航天大学在医学信息工程方面也有较好的发展，适合有志于在该领域发展的学生。
复旦大学：
复旦大学在医学信息工程领域有较高的声誉，教学和研究实力强。
上海交通大学：
上海交通大学在医学信息工程方面也有很好的表现，是一个值得考虑的选项。
中山大学：
中山大学在医学信息工程领域享有很高的声誉，教学设施完善，适合有志于在该领域发展的学生。
北京大学医学部：
作为国内顶尖的医学院校，北京大学医学部在医学信息工程方面有丰富的教学和研究资源，是一个理想的选择。
北京协和医学院：
北京协和医学院是中国较早设有八年制临床医学专业和护理本科教育的重点医学院校，医学信息工程专业实力强。
这些学校各有优势，建议根据个人的兴趣、学术背景和职业规划，综合考虑选择最适合自己的院校。