制药工程跨专业考研的方向主要包括：
药物化学：
研究药物合成和设计，毕业生多选择医药生产企业和药政机构。
化学工程与技术 （简称化工）：研究化学工业及其他工业过程中的原理和规律，毕业生多从事冶金、能源等科研工作。药学：
学习药学各分支学科的基本理论和知识，具备药物制备和质量控制能力，就业前景广阔。
中药学：
研究中药材的采集、加工、炮制和药理，毕业生多从事中药检验和科研工作。
生物技术及相关专业：利用生物技术生产药物，与药物制剂有密切联系。
药剂学：
研究药物制剂和药物释放系统，涉及药物剂型设计、稳定性、生物利用度等。
生物制药：
利用生物技术生产药物，关注生物药物的合成、稳定性和释放。
药理学：
研究药物作用机制，涉及药物作用、副作用和治疗窗等。
选择考研方向时，建议根据个人兴趣和职业规划进行综合考虑。