设施农业科学与工程专业的考研方向主要包括以下几类：
农业工程：
关注农业领域的工程技术研究，包括农业机械化、农业自动化、农业生物环境工程等。
设施农业：
侧重于设施农业的技术研究，如温室、植物工厂、农业园区规划等。
园艺学：
关注园艺植物的栽培、育种、生理等方面的研究。
植物与微生物互作：
研究植物与微生物之间的相互作用，如植物病理学、植物保护等。
农业资源与环境：
关注农业资源管理、农业生态、环境科学等方面的研究。
农产品加工与贮藏：
研究农产品加工、保鲜、贮藏等方面的技术。
农业经济管理：
关注农业经济、农业政策、农业企业管理等方面的研究。
此外，设施农业科学与工程专业还可以考取与设施农业科学与工程相关的其他专业，例如植物学、农业推广等。
建议在选择考研方向时，结合个人兴趣和职业规划，选择最适合自己的专业。例如，如果对农业机械化感兴趣，可以选择农业工程方向；如果对园艺植物的栽培和育种感兴趣，可以选择园艺学方向。