分子科学专业考研院校排名如下：
北京大学
清华大学
上海交通大学
中国科学技术大学
复旦大学
浙江大学
武汉大学
华中科技大学
南京大学
南开大学
中山大学
四川大学
北京化工大学
天津大学
哈尔滨工业大学
北京航空航天大学
厦门大学
首都医科大学
东北师范大学
华南理工大学
建议：
北京大学和 清华大学在高分子科学领域具有极高的声誉，科研实力强，是考研的理想选择。
浙江大学在高分子化学方向表现突出，适合在该领域深造。
复旦大学和 南京大学在理科方向有优势，尤其是高分子性能形态研究。
北京化工大学和 华南理工大学在工科方向，特别是高分子加工方向有很高的声誉。
天津大学和 南开大学等学校也在分子科学与工程专业上有很好的表现，可以根据个人兴趣和职业规划进行选择。