关于硕士研究生扣除工龄的问题，主要依据个人的学习情况、是否在职以及是否缴纳社保等因素来确定。以下是具体的处理方式：
应届毕业生
如果你是应届毕业生且之前没有任何工作经验，那么读研究生期间是不计算工龄的。工作年限是从你档案进入工作单位所在人才市场并且开始有单位交五险一金开始计算的。
在职人员
对于在职人员，如果已经开始交了五险一金，并且得到单位的允许委培读全日制研究生，档案不转入学校，在读期间单位继续帮你交五险一金，那么研究生在读期间也是计入你的工作年限的。
如果在职人员利用业余时间学习，并且正常缴纳了社保和签订了劳动合同，那么这段时间是计算工龄的。但如果没有缴纳养老保险，则这段时间不计入工龄。
特殊情况
如果全日制研究生的前置学历（如本科或大专学历）不被承认，导致其研究生学历也无法被承认，那么在这种情况下，研究生期间的工龄是需要被扣除的。这是因为工龄和工资的计算是基于学历学位水平的，如果前置学历不被认可，那么后续的研究生学历也就失去了计算工龄的依据。
法律依据
依据《中华人民共和国关于博士生和在职人员考取硕士生学习期间工龄计算问题的通知》，在职人员若成功考上国内硕士研究生，在学术研习期间将会被计算工龄；而那些选择远赴海外攻读硕士学位的在职人员，若是在取得硕士学位后归国工作，在规定的学习年限内同样会被算入工龄。
建议
在职人员：如果打算在职期间攻读研究生，建议尽早与所在单位沟通，了解相关政策和操作流程，确保研究生期间的工龄能够被正确计算。
应届毕业生：如果计划继续深造，可以考虑在就业前完成学业，以免影响工作年限的计算。
希望以上信息对你有所帮助。如果有更多具体问题或需要进一步的咨询，建议联系相关的人力资源部门或法律专家。