南京的军校考研有以下几个选项：
中国人民解放军理工大学
简称“理工大”，是中央军委直属的高等军事工程技术院校，被誉为“兵工七子”之一。
中国人民解放军国际关系学院
主要培养国际关系、军事外交等方面的专业人才。
南京政治学院
隶属总政治部领导，是全军院校教学优秀单位，军队“2110工程”重点建设院校。
南京陆军指挥学院
直属中央军委联合参谋部，是中级指挥院校，主要培养全军指挥军官中级培训和研究生。
南京炮兵学院
主要培养炮兵专业军官。
国防科技大学
由中央军委直属，是“211工程”、“985工程”和“双一流”建设高校，全军研究生培养单位重点建设院校。
中国人民解放军陆军工程大学
副军级专业类高等教育院校，校本部位于江苏南京，涵盖多个专业领域，如陆军信息保障、工程兵、装备保障等。
中国人民解放军海军指挥学院
海军中级任职教育院校，主要培养海军中级指挥与参谋军官、军事学博士、硕士研究生等。
中国人民解放军国防大学政治学院南京校区
国防大学下属的政治学院在南京的校区，主要承担军事政治方面的教学和研究任务。
中国人民解放军陆军炮兵防空兵学院南京校区
位于安徽合肥，但南京设有分院，主要培养炮兵和防空兵专业军官。
这些院校在各自的军事领域内具有很高的声誉，并且为军队培养了大量高素质的指挥和专业技术人才。建议根据个人兴趣和专业方向选择合适的院校进行报考。