自主命题的高校包括：
1. 北京航空航天大学
2. 北京理工大学
3. 中国农业大学
4. 北京师范大学
5. 南开大学
6. 天津大学
7. 大连理工大学
8. 东北大学
9. 吉林大学
10. 哈尔滨工业大学
11. 复旦大学
12. 同济大学
13. 上海交通大学
14. 南京大学
15. 东南大学
16. 浙江大学
17. 中国科学技术大学
18. 厦门大学
19. 山东大学
20. 武汉大学
21. 华中科技大学
22. 湖南大学
23. 中南大学
24. 中山大学
25. 华南理工大学
26. 四川大学
27. 电子科技大学
28. 重庆大学
29. 西安交通大学
30. 西北工业大学
31. 兰州大学
32. 中国人民大学
33. 清华大学
34. 北京大学
35. 浙江大学
36. 上海交通大学
37. 复旦大学
38. 北京化工大学
39. 中国青年政治学院
40. 北京邮电大学
41. 北京城市学院
42. 天津商业大学
43. 天津外国语大学
44. 河北师范大学
45. 南方医科大学
46. 赣南医科大学
47. 中国医科大学
48. 集美大学
49. 河海大学
50. 北方工业大学
51. 武汉理工大学
52. 四川大学
这些高校拥有自主命题权，可以自行组织招生考试试卷的编写。具体院校名单可能会根据每年的考研招生简章有所更新，建议查看最新的招生简章以获取最准确的信息。