考研辅导协议档案的存放位置主要取决于个人的情况，包括是否已经毕业以及是否签订了三方协议等因素。以下是具体的存放位置：
在校大学生
档案存放在本科所读院校，考研报名时需要填写档案所在单位及档案所在单位的地址，这两个地方应分别填写本科院校和本科院校的地址。
大学毕业生
已签订三方协议：学校会自动将档案邮寄到工作单位或工作单位所在地的人才市场。
未签订三方协议：
档案可能会留存学校，方便第二年无论是升学还是就业时调动档案或申请政审。
档案也可以派遣回生源地人才中心。
其他特殊情况
个别情况下，人事档案可能会在人事局或具体单位（如中省直事业单位或企业），这通常适用于有用人自主权的单位。
建议
已毕业且签订三方协议：确保三方协议中的档案接收单位信息准确无误，以便学校能够顺利将档案邮寄到指定位置。
未毕业：如果计划考研，建议档案继续留在学校，这样在考研过程中无需处理档案转接事宜。
已毕业但未签订三方协议：可以根据自己的职业规划选择将档案留存学校或派遣回生源地人才中心，提前了解相关流程和注意事项。
希望这些信息对你有所帮助。如果有更多具体问题或需要进一步的帮助，请随时咨询相关机构或学校。