专业硕士在职研究生与一般意义上的专业硕士（全日制研究生）之间的区别主要体现在以下几个方面：
性质与培养方式
专业硕士：是硕士学位的一种类型，侧重于培养具有厚实理论基础和适应特定行业或职业的应用型高层次专门人才。
在职研究生：是以在职人员的身份，部分时间在职工作，部分时间在校学习的研究生学历教育类型，包含专业硕士和非全日制研究生等多种形式。
报名条件
专业硕士：对报名人员的学历要求较高，通常要求具备一定的工作经验，有的专业还要求单位推荐或经过管理部门的赞同。
在职研究生：报名门槛相对较低，大专及以上学历即可报名，部分专业硕士项目对工作经验没有明确要求。
报考方法
专业硕士：通常需要参加全国统一组织的入学考试，包括初试和复试。
在职研究生：除了非全日制专业硕士需要参加入学考试外，还有同等学力申硕等方式，后者可以先到校学习再参加考试。
入学方式
专业硕士：无论非全日制还是全日制，均需要先考试后入学。
在职研究生：同等学力申硕是先入学后考试，其他形式如非全日制研究生则是先考试后入学。
证书发放
专业硕士：无论非全日制还是全日制，毕业后均可获得硕士学历证和学位证。
在职研究生：同等学力申硕方式下，学员最终获得的是硕士学位证，无学历证。
学习方式
专业硕士：通常为全日制学习，注重理论与实践的结合。
在职研究生：学习方式较为灵活，包括周末班、节假日班和寒暑假班等，属于非脱产教育。
根据以上区别，在职人员可以根据自身的实际情况和职业发展需求，选择合适的专业硕士在职研究生项目。如果希望获得双证且具备一定的工作经验，专业硕士的非全日制研究生项目可能更为合适；如果希望在工作的同时提升学历，且对工作经验没有严格要求，可以选择同等学力申硕等方式。