扬州723研究所的硕士研究生待遇如下：
入职一年内（含试用期半年）
固定工资：本科生3000元/月，硕士4600元/月。
交通补助：500元/月（试用期满后700元/月）。
一年后
根据岗位实行岗位工资、效益工资、年度岗位考核称职及以上者，税前综合收入硕士不低于9万元。
其他福利
研究生没有事业编制，属于企业化管理正式员工。
研究所正在改制，需注意是与七一二所签劳动合同，还是与七一二所下属公司签合同。
建议：
硕士毕业生在入职初期会有较高的固定工资和交通补助，整体待遇较为优厚。
试用期结束后，随着岗位工资和效益工资的增加，税前综合收入将进一步提升。
由于研究所正在改制，建议毕业生在签订劳动合同时，明确合同主体，了解相关权益。