种子科学与工程专业考研的主要方向包括：
作物遗传育种：
这个专业方向主要研究作物的遗传规律和育种技术，目的是培育出具有优良性状的新品种。这个领域涉及到基因工程、分子标记辅助育种、杂交育种等多种技术手段。
作物栽培学与耕作学：
这个专业方向主要研究作物的高产、优质、高效栽培技术以及耕作制度的设计。它涵盖了作物生产的关键技术问题、作物生理生化研究、农村资源环境综合研究以及农业生产系统分析与耕作制度设计等领域。
作物学：
这个专业方向是一个更为宽泛的领域，涵盖了作物生产、作物生理、作物生态、作物遗传育种等多个方面。它旨在培养具备植物育种、种子加工贮藏、种子质量检测、种子营销及其相关领域的基本理论、基本知识和基本技能的应用型高级人才。
此外，还有一些扩展方向，例如作物杂种优势机理及利用、作物分子育种及细胞工程、作物基因组学等。
建议
选择专业方向：根据个人兴趣和研究方向，可以选择作物遗传育种、作物栽培学与耕作学或作物学中的一个或多个方向进行深入研究。
了解学校和专业：不同学校的考研科目和要求可能有所不同，建议提前了解并选择合适的学校和导师，以确保考研的成功。
注重实践：种子科学与工程是一个应用性很强的专业，因此在研究生阶段应注重实践能力的培养，积累实际工作经验。