南京提供研究生教育的大学包括：
南京大学- 综合类大学，拥有强大的学科优势和丰富的研究生导师资源。
东南大学- 985工程高校，以工科、理科见长，在建筑领域具有较高声誉。
南京理工大学- 工科类大学，由工信部、教育部和江苏省共建，是“211工程”和“985工程”高校。
南京航空航天大学- 以航空航天为特色的研究生院校，是国防科工局直属高校。
河海大学- 在水利工程领域有显著优势。
南京农业大学- 以农业和生命科学为主。
南京师范大学- 综合文科类大学，教育领域具有较高声誉。
中国药科大学- 在药学领域有很强的实力。
南京信息工程大学- 在大气科学、环境科学等领域有优势。
南京邮电大学- 以电子信息为特色，通信、计算机领域学术水平高。
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