考研408计算机科学专业基础综合的难度排行榜中， 清华大学、北京大学和上海交通大学被认为是难度最高的学校，这三所学校均属于顶尖难度级别。此外， 浙江大学和 中国科学技术大学也被归为第一梯队，难度同样很高。
具体分析如下：
清华大学和 北京大学的计算机专业在全国乃至全球都享有盛誉，竞争非常激烈，要求考生具备扎实的基础和出色的科研能力。这两所学校的录取标准极高，考生需要在初试和复试中表现出色。
上海交通大学的计算机专业在国内外享有很高的声誉，招生名额有限，竞争激烈。
浙江大学和 中国科学技术大学也是408统考中难度较高的学校，属于第一梯队。
综上所述，如果你打算报考计算机科学专业的研究生，并且希望进入顶尖高校，那么清华大学、北京大学和上海交通大学是难度非常大的选择。如果你对这些学校没有太大的把握，可以考虑其他985高校，如浙江大学、中国科学技术大学、复旦大学、同济大学等，这些学校的难度相对较低一些。