考研机构交税的方式如下：
增值税
增值税一般纳税人应按适用税率6%计算增值税销项税额，同时进项税准予抵扣。
小规模纳税人应按征收率3%计算缴纳增值税。同时需要注意纳税人实际向税务机关缴纳增值税，应同时缴纳城建税、教育费附加和地方教育附加。
企业所得税
企业所得税的税率为25%。
居民企业应当就其来源于中国境内、境外的所得缴纳企业所得税。企业每一纳税年度的收入总额，减除不征税收入、免税收入、各项扣除以及允许弥补的以前年度亏损后的余额，为应纳税所得额。
非居民企业在中国境内设立机构、场所的，应当就其所设机构、场所取得的来源于中国境内的所得，以及发生在中国境外但与其所设机构、场所有实际联系的所得，缴纳企业所得税。
其他税种
培训机构交税需要缴纳营业税、注册资金印花税、财产租赁印花税。
营业税的起征点为月营业额1000-5000元；按次纳税的起征点为每日（次）营业额100元。营业额达到起征点的全额计税，未达起征点的免缴营业税。
建议
咨询当地税务部门：由于税收法规可能会有更新或特殊情况，建议考研机构在交税前咨询当地税务部门或专业税务顾问，以确保准确合规地缴纳税款。
合理规划财务：考研机构应根据自身的财务状况和税务法规，合理规划收入和支出，确保合法合规地享受税收优惠政策。