清华大学机械工程系
清华大学机械工程系是我国最早开创机械电子工程专业的高等学府之一，学科实力强劲。该专业重点培养学生的机械基础及其指导科学、机械电子控制、数值计算与计算机应用等方面的知识与技术。
北京航空航天大学机械学院
北京航空航天大学机械学院有机械工程、机器人工程、机械设计制造及其自动化等多个理工类硕士学位授权点，科研实力雄厚。机械电子工程专业重点培养机械制造、自动化控制和电子信息等方面的高水平人才。
西安交通大学机械学院
西安交通大学机械学院是国内一流的机械工程领域的高等学府之一，提供机械电子工程硕士学位授权点。该学院有一支优秀的师资队伍和先进的实验室设备，注重知识的传授和应用。
上海交通大学机械与动力工程学院
上海交通大学机械与动力工程学院在机械工程领域具有较高的声誉和实力。学院的机械工程学科在学科评估中排名第一，动力工程及工程热物理学科排名第三，核科学与技术排名第五。机械电子工程考研的学生将能够获得优质的教育资源和专业培养。
华中科技大学机械科学与工程学院
华中科技大学机械科学与工程学院是机械考研的主要院校之一，在教育部第四轮的学科评估中，华中科技大学的机械工程学科获得A+评分，仅次于清华大学和西安交通大学。
西安电子科技大学机电工程学院
西安电子科技大学是国家教育部直属、以电子与信息学科为特色的全国重点大学，机械考研主要是在机电工程学院。
广西科技大学机械工程学院
广西科技大学机械工程学院设有机械工程及自动化（模具设计与制造方向）、机械工程及自动化（数控技术方向）、工业设计、机械电子工程4个本科专业和硕士研究生专业机械设计及理论。其中机械工程及自动化专业是广西科技大学首个国家级特色专业建设点。
湖南工业大学机械工程学院
湖南工业大学机械工程学院是湖南工业大学最早设立的院系之一，拥有享受政府特殊津贴的专家、博士生导师、硕士生导师、教授和副教授等丰富的教学资源。
三峡大学机械与材料学院
三峡大学机械与材料学院设有机械设计制造及其自动化、材料成型及控制工程、金属材料工程、工业工程、能源动力及自动化、新能源材料与器件六个本科专业，其中机械设计制造及其自动化为国家特色专业。
湖北工业大学机械工程学院
湖北工业大学机械工程学院前身是1985年由原湖北农业机械专科学校农业机械专业与湖北轻工业学院机电系轻工机械专业合并组建的机械工程系，具有较高的教学和研究水平。
这些研究院所在机械电子工程领域都有较强的科研实力和丰富的教学经验，可以根据个人的兴趣、学术目标和地理位置等因素进行选择。建议进一步了解各研究院所的具体研究方向、导师队伍和科研设施，以便做出更为明智的选择。