与微生物相关的考研专业主要有以下几个方向：
资源与应用微生物学：
研究微生物资源的开发和应用，包括微生物在农业、工业、医学等领域的应用。
病源微生物学：
研究病原微生物的生物学特性、致病机制和防治方法。
微生物发酵与代谢工程：
研究微生物发酵过程及其代谢产物的开发利用。
生物防治微生物学：
研究利用微生物进行生物防治的技术和方法。
环境微生物学：
研究微生物在环境中的分布、作用及其与环境污染的关系。
真菌学：
研究真菌的形态、生理、生态、分类和遗传学等。
微生物学：
研究微生物及其生命活动的基本规律和应用的科学，包括微生物的形态结构、生理代谢、遗传变异、生态分布、分类进化等。
分子生物学：
研究生物大分子的结构与功能，包括核酸、蛋白质、基因等。
生物化学：
研究生物机体的化学组成和生命过程中的化学变化及其规律。
生物工程：
应用生物学原理和技术进行工程设计和操作，包括生物制品的生产、生物系统的设计和调控等。
生物医学工程：
结合生物学和工程学原理，研究用于疾病诊断、治疗和预防的工程技术和装置。
学科教学（生物）：
培养具备现代教育理念和较高水平的中学生物教学和研究能力的中学生物教师。
这些专业方向涵盖了微生物学的各个方面，学生可以根据自己的兴趣和职业规划选择合适的专业进行深入研究。推荐的考研院校包括山东大学、复旦大学、北京大学、中国农业大学、华中农业大学、中山大学、南开大学、清华大学、浙江大学、南京农业大学、西南大学等。