学费最低的硕士研究生项目如下：
北京农学院：
全日制研究生学费为5000元/年，非全日制研究生学费为6000元/年。
石河子大学：
全日制学硕研究生学费为5800元/年，全日制专硕研究生学费为6000元/年。
塔里木大学：
全日制学硕研究生学费为5800元/年，全日制专硕研究生学费为6000元/年。
西藏农牧学院：
农林类学费为5000元/年，理工类学费为6000元/年，医学类学费为7000元/年。
北方工业大学：
会计专硕（MPAcc）项目学费为7000元/年。
中央民族大学：
金融专硕项目学费约为16000元/年。
中国海洋大学：
金融专硕项目学费约为16000元/年。
此外，还有一些国际院校提供较低学费的一年制硕士项目，例如：
瑞士商学院：
工商管理（MBA）、医疗健康管理硕士、文化艺术管理硕士等项目学费约为5.8万至5.98万人民币/年。
法国巴黎商学院：
部分项目学费较低，具体金额未详细列出，但属于性价比较高的选择。
建议在选择硕士研究生项目时，综合考虑学校的地理位置、专业设置、学费及其他费用，以确保选择到最适合自己的项目。