总体结论是， 中南大学应用统计专业的考研难度总体上高于重庆大学。两校都是985/211高校，在应用统计领域都有较强实力，不过重大更具性价比。具体来说：
综合实力和专业排名：
中南大学应用统计专业的综合实力和专业排名略高于重庆大学，报考竞争更激烈。
地理位置：
两校都位于阅卷较水区，地理位置优势相当。
录取数据：
从最新一年的录取数据看，中南大学的复试线（380分）高于重庆大学（355分），上岸难度相对较高。
招生规模：
重庆大学的招生规模更大，录取机会相对更多。重庆大学近年来发展迅速，排名有所上升。
因此，如果你打算报考应用统计专业，且希望留在长沙或周边地区，中南大学的考研难度可能会更适合你。如果你计划留在南京或苏南、长三角地区工作，可以考虑东南大学，因为该校在该地区的校友及导师资源更丰富。