生物医学工程考研可以选择的专业主要包括：
微生物学：
研究微生物及其生命活动规律，应用于工业发酵、医药卫生、生物工程和环境保护等领域。
生物医学工程：
结合工程原理、方法和技术于生物医学研究和临床应用，研究方向包括生物力学与康复工程学研究、生物医学信号处理研究、医学图像处理与分析研究等。
电子与通信工程：
研究信息传输、交换、处理、信号检测，集成电路设计与制造，电子元器件，微波与天线，仪器仪表技术，计算机工程与应用等。
生物制药工程：
涉及药物工艺、制剂设计与研究、生物制品生产技术等内容。
生物工程：
研究生物系统的工程应用，包括生物反应过程、生物制品生产等。
生物化工：
运用化学工程科学原理和方法，研究生物反应过程中的基础理论及工程技术问题。
生物信息学：
研究生物信息的获取、处理、存储和应用。
细胞生物学 、 生理学、 海洋生物学、 农学：
这些学科虽然与生物医学工程关系不大，但作为考研的备选方向，也有一定的参考价值。
选择考研专业时，建议考虑自己的兴趣、专业背景以及未来的职业规划。同时，关注目标院校的招生信息，了解各专业的考试要求和研究方向，以便做出最适合自己的选择。