自动化专业考研的选择，可以考虑以下几所院校：
北京航空航天大学：
被认为是自动化领域最好的学校之一。
东北大学、哈尔滨工业大学、西北工业大学、山东大学：
这些学校的自动化专业也非常强，尤其是哈尔滨工业大学和山东大学，同时还有中科院的研究所可以考虑。
重庆邮电大学：
复试分数线与国家线一致，录取人员成绩没有高出很多，相对容易考取。
北京交通大学：
自动化专业获批国家级一流本科建设点，专业课考察内容少，适合跨考生或零基础考生报考。
南京信息工程大学：
有自动化学院，专业课分数普遍较高，对跨考生有利。
天津大学、华南理工大学、上海交通大学、河海大学、东南大学、湖南大学、武汉大学：
这些学校也是自动化专业考研的不错选择。
建议
如果追求学术研究和专业深度，可以考虑北京航空航天大学、东北大学、哈尔滨工业大学等顶尖高校。
如果注重就业和相对容易的考取难度，重庆邮电大学、南京信息工程大学、北京交通大学等是不错的选择。
如果有跨专业的打算，可以考虑自动化专业与通信专业相关的交叉学科，这样在考研时可能会有所优势。
希望这些建议能帮助你找到最适合自己的考研院校。