南京大学在考研中确实设有专业课。南京大学提供考研辅导班，涵盖多个院系的专业课辅导科目，例如哲学系、商学院、马克思主义学院、法学院、政府管理学院、社会学等，具体科目包括哲学综合、马克思主义哲学史、中国哲学原著与东方宗教、西方哲学、形式逻辑基础、伦理学原理、宗教学概论、科学技术哲学、经济学原理、金融学综合、管理学原理、中国近现代史、马克思主义基本原理和原著、法律硕士专业基础、法律硕士综合、政治学基础、行政管理学、社会保障理论与制度、社会学理论等。
此外，对于特定专业如水利工程，考研科目分为公共基础课和专业课，其中专业课包括水利工程结构分析、水利工程施工与管理、水利工程监测与控制、水利工程设计、水利工程建设技术经济分析、水利工程可持续发展等。
对于法律硕士，考研需要考四门，包括全国统考的政治、英语一，以及两门专业课，如公共管理基础和社会保障理论。
其他专业如建筑学、金融硕士、教育硕士、工商管理硕士、公共管理硕士、应用统计硕士、应用心理硕士、社会工作硕士、国际商务硕士、图书情报硕士、文物硕士、临床医学硕士、博物馆硕士、国际中文教育硕士、电子信息、工程管理硕士、材料与化工、资源与环境等，考试科目根据专业不同有所不同，一般包括思想政治理论、外语、专业课一和专业课二。
综上所述，南京大学在考研中设有专业课，涵盖了多个学科领域，具体科目和考试内容可以查阅南京大学研究生院发布的官方信息。