微生物专业的考研方向主要涉及理学门类下的生物学一级学科，具体考研院校和学院如下：
哈尔滨工业大学市政学院环境工程
哈尔滨工业大学的市政学院环境工程专业有微生物相关的研究方向，适合对微生物制剂、分子生物学等方面感兴趣的考研学生。
中国科学院微生物研究所
中国科学院微生物研究所是微生物研究的重要机构，适合希望在微生物领域深入研究和发展的学生。
大理学院基础医学院
大理学院基础医学院的研究生招生专业为“病原生物学”，涵盖医学微生物学、医学寄生虫学、临床病毒学等多个研究方向。
其他高校
北京的院校如中国农业大学、北京协和医学院、首都师范大学、中国人民解放军军事医学科学院、北京林业大学和中国科学院大学都有微生物专业的研究生招生。
天津的南开大学也提供微生物专业的研究生招生。
其他如江南大学、南京农业大学、云南大学、山东大学等也是微生物学考研的热门院校。
建议
选择院校：根据个人兴趣和研究方向选择合适的院校，如对医学微生物学感兴趣可以选择大理学院基础医学院，对微生物制剂感兴趣可以选择哈尔滨工业大学市政学院环境工程。
关注导师：选择有丰富研究经验和优秀学术成果的导师，这对研究生阶段的学习和研究非常重要。
了解实验室和科研条件：选择有先进实验室和科研条件的院校，有助于提升研究能力和实验技能。
希望这些信息对考研的学生有所帮助。