考研机构被投诉后，教育局相关部门会进行查实，确认是否存在违规行为。如果投诉内容属实，根据违规的严重程度，考研机构可能会面临以下处理：
停办整顿：
对于违规行为较轻的考研机构，教育局可能会责令其停办并进行整顿，要求其在规定时间内完成整改。
关闭机构：
对于违规行为严重的考研机构，教育局可能会直接责令其关闭，并依法进行处罚。
退还费用：
如果投诉涉及乱收费等问题，考研机构可能需要退还相关费用给投诉者。
赔偿损失：
如果投诉涉及学生受到体罚或变相体罚等伤害，考研机构可能还需要承担相应的赔偿责任。
公开通报：
教育局还可能会对违规的考研机构进行公开通报，以警示其他教育机构遵守相关规定。
建议考研机构在运营过程中严格遵守相关法律法规，维护良好的教育环境，以减少被投诉的风险。