考研时区分农工理主要依据以下几个方面：
研究方向
理学（科学）硕士侧重于理论研究，例如数学、天文学、光学、物理学、化学、地理学等。
工学（工程）硕士注重实际应用和技术创新，研究机械工程、电子工程、建筑工程、计算机科学等工程领域。
学科内容
理学包含广泛的学科领域，强调对自然规律的理解和学术问题的解答。
工学则是针对特定领域的应用研究，以解决实际生产问题为主要目的。
职业出路
理学毕业生常从事学术研究或教育工作，如在大学或科研院所任教或从事科学实验室研究。
工学毕业生更可能从事技术开发、工程设计、企业管理等工程技术方面的工作。
考试准备
理学考生需要重点掌握基础理论知识，灵活应用数学工具。
工学考生则需要掌握实际应用技能，如软件开发等。
学生结构
理学专业中女生较多，尤其是统计学、心理学等专业。
工学专业则以男生为主，只有少数三本院校的工科专业允许高中文科生报考。
招生对象
理学硕士招收的是理科类专业的本科生。
工学硕士招收的是工科类专业的本科生。
培养目标
理学硕士培养具有扎实理论基础的人才。
工学硕士培养具有扎实理论基础和实践能力的应用型人才。
通过以上几点，可以较为清晰地判断考研时农工理的差异。