自考药学考研的院校包括以下几所：
中国药科大学：
位于江苏省南京市，药学专业是国家一级重点学科，具有较高声誉。
沈阳药科大学：
中国历史悠久的综合性药科大学，药学是国家级重点学科。
北京大学：
药学专业实力强，是医学“双一流”建设联盟成员。
复旦大学：
名气大，学科实力强，药学院在药物化学领域具有领先地位。
浙江大学：
综合性全国重点大学，药学专业排名靠前。
中国医科大学：
药学专业实力强，有多个药学院。
南京中医药大学：
药学专业考研较好的学校之一。
山东第二医科大学 （前身为潍坊医学院）：是山东省省属全日制普通高等医学院校，药学专业是自考本科的热门专业。
兰州大学：
药学自考专业热门，每年有众多考生选择。
这些院校在药学领域具有较高声誉和学术实力，是自考药学考研的不错选择。建议根据个人兴趣、学术目标和地理位置等因素，综合考虑这些院校进行选择。