南京大学和复旦大学都是中国顶尖的高等学府，考研难度都很大，但具体哪个更好取决于个人的情况和需求。以下是它们之间的一些比较和建议：
学术水平和科研成果
南京大学：在人文社会科学、自然科学、工程技术等领域都有很高的学术水平和科研成果，其中国家级科研项目和奖项的数量也非常多。南京大学拥有一批优秀的学者和科学家，如著名物理学家欧阳钟灿、著名化学家熊卫平等。
复旦大学：在人文社会科学、自然科学、医学等领域也有很高的学术水平和科研成果，其科研实力非常强大。复旦大学拥有一批优秀的教授和学者，如著名经济学家张军、著名生物学家陈竺等。
师资力量
南京大学：拥有众多优秀的教授和学者，他们在各自领域内都有很高的学术造诣和影响力。
复旦大学：同样拥有一批优秀的教授和学者，他们在各自领域内都有很高的学术造诣和影响力。
校园环境和氛围
南京大学：校园环境以古典园林为主，校园文化注重传统文化的传承和创新。
复旦大学：校园环境以现代建筑为主，校园文化注重国际化和创新精神的培养。
专业优势
南京大学：在物理学、地理学专业方面比较有优势。
复旦大学：在社会科学类学科、国际关系、经济学专业方面比较有优势。
考研难度
南京大学：相对容易一些，但具体难度也取决于专业和报考人数。
复旦大学：难度较大，尤其是对于外地学生来说，但上海的优势和复旦的知名度也是吸引考生的重要因素。
建议：
如果你对人文社会科学、自然科学和工程技术等领域有浓厚的兴趣，那么南京大学可能更适合你。
如果你对医学、自然科学和人文社会科学等领域有浓厚的兴趣，那么复旦大学可能更适合你。
在选择学校时，还需要考虑自己的学习氛围、城市偏好以及未来的职业规划。
具体到考研，如果南京大学的教育学确实比复旦大学强，并且你特别看重文凭的含金量，可以考虑南京大学的教育学硕士。但总体来说，两所学校都是顶尖高校，选择哪个更好需要根据个人的兴趣、目标和实际情况来综合考虑。