制药工程考研的专业方向主要包括：
药理学：
研究药物与机体间的相互作用规律及其作用机制，包括药效动力学和药代动力学。
药剂学：
研究药物制剂的基本理论、处方设计、生产工艺、合理应用，以及药物制剂与药物吸收、分布、代谢及排泄的关系。
中药学：
培养具备中药学基础理论和知识，能在中药生产、检验、流通、使用和研究与开发领域工作的高级科学技术人才。
药物化学：
研究药物的合成、结构、性质及药物分子与生物大分子相互作用的规律。
药物分析：
研究药物及其制剂的质量评价、质量控制、安全性检测等方面。
微生物与生化药学：
涉及利用微生物和生化技术进行药物的研究和生产。
药事管理：
涉及药品的注册、生产、流通、使用等环节的管理和监督。
发酵工程：
利用微生物发酵技术进行药品的生产。
化学工程与技术：
结合生物质能源、新能源、绿色化学品等特色，培养化学工业领域的高素质人才。
生物制药：
利用生物技术手段制备药物，包括基因工程药物、生物制品等。
天然药化：
研究天然药物的成分、结构及其生物活性。
生药学：
研究药用植物、动物和矿物的来源、鉴定、药效物质基础及开发利用。
这些专业方向为制药工程领域的学生提供了多样化的研究生学习路径，可以根据个人兴趣和职业规划进行选择。