南航的冷门专业包括：
核工程专业：
南京航空航天大学的核工程专业相对较冷，就业面较窄，但就业前景不错，竞争也较小。毕业生起步工资在6千元左右一个月。考研时，可以选择核科学与技术、核能与核技术工程、核能科学与工程、核技术及应用等专业。
飞行器制造工程维修与技术专业：
这个专业属于航空航天类专业，相对于一些传统的热门专业，可以说是相对冷门的专业之一。但由于航空航天工程是一个高科技领域，随着我国航空航天事业的快速发展，对于该领域的专业人才需求也在增加。
土木工程：
土木工程专业是南昌航空大学科技学院首批招收学生的专业之一，经过十余年的发展，已成为科技学院重要的一门工科学科。专业方向主要为建筑工程方向。
焊接技术与工程：
这个专业以新型连接技术为发展核心，培养具有专业技术与管理能力兼备的复合型高水平人才。焊接技术与工程专业是该院重点特色专业。
戏剧戏曲学专业：
虽然这个专业可能不是典型的“冷门”专业，但相对于其他更热门的专业，如计算机科学、电子工程等，它可能招生人数较少，竞争也较小。南京航空航天大学艺术学院的戏剧戏曲学专业在考研时也是一个选择。
这些专业的冷门程度可能因个人兴趣、职业规划以及行业需求而有所不同。建议在选择专业时，综合考虑自己的兴趣和长期职业规划，同时关注行业发展的趋势和需求。