考研初试中自命题的科目主要包括以下几类：
专业课
计算机科学与技术学科专业基础综合
教育学专业基础综合
心理学专业基础综合
历史学基础
数学（农）
化学（农）
植物生理学与生物化学
动物生理学与生物化学
口腔医学专业学位的临床医学综合能力
其他未明确列出的专业课程
单独考试的初试科目
由招生单位自行命题，也可选用全国统考试题
部分院校自主命题的科目
例如，中南民族大学、三峡大学、海军工程大学、湖南农业大学、湖南师范大学、重庆师范大学、江西农业大学、华东理工大学、福建师范大学、福建农林大学等院校的部分专业课程
需要注意的是，具体哪些科目是自主命题的，还需要查看报考院校的招生简章和其他相关通告，因为不同学校和专业的自主命题科目可能会有所不同。此外，有些科目可能既有全国统考的版本，也有自主命题的版本，例如英语科目，考研初试中的英语一和英语二分别为统考科目，而其他院校可能会自主命题英语科目。