曲阜师范大学提供多个学科的研究生教育和考研机会，其中包括但不限于以下专业：
化学
物理
数学
语文
英语
工程学
计算机科学
材料科学
中国史
中国语言文学
教育学
体育学
运筹学与控制论
光学
专门史
外国语言学及应用语言学
中国古代文学
野生动植物保护与利用
应用数学
体育人文社会学
中共党史
基础数学
物理化学
理论物理
人文地理学
成人教育学
汉语国际教育
应用心理学
中国现当代文学
政治经济学
曲阜师范大学以其师范教育为特色，同时注重多学科协调发展，拥有较高的考研率和成功率。学校提供全日制及非全日制的专业硕士和博士教育，并面向海内外招生。