考研选择南京还是合肥，主要取决于个人的目标和需求。以下是它们之间的一些比较和建议：
办学力量和学科实力
南京：南京拥有丰富的经济与教育资源，拥有多所知名高校，如南京大学、东南大学、南京理工大学和南京航空航天大学。这些学校在多个学科领域都有很高的学术水平和研究实力，特别是在工程、信息科学和材料科学等领域。
合肥：合肥同样拥有多所知名高校，如中国科学技术大学、合肥工业大学和安徽大学。其中，中国科学技术大学在科研和学术方面享有很高的声誉，而合肥工业大学和安徽大学也在各自的领域有着不错的表现。
专业设置和招生要求
南京：南京理工大学和南京航空航天大学的控制学科评估都为B+，且这两所学校的专硕要求考数学二和英语二，相对较为宽松。此外，南京的高校在招生时对数学的要求相对较高，但英语要求相对较低。
合肥：合肥工业大学和安徽大学在控制学科方面也有一定的实力，其中合肥工业大学的控制学科评估为B-，安徽大学为C+。在招生方面，合肥工业大学的专硕要求考数学一和英语一，相对较为严格。
就业和地域优势
南京：南京作为长三角地区的重要城市，拥有众多知名企业和研发机构，就业前景广阔。此外，南京高校的学生在就业时通常具有较大的地域优势，能够更容易地在上海、杭州等周边城市找到工作。
合肥：合肥虽然发展迅速，但相比南京在就业方面仍有一定的差距。然而，合肥作为安徽省的省会，在安徽地区具有很高的认可度，毕业生在安徽本地及长三角地区的就业前景也相对较好。
个人偏好
南京：如果你更看重学术氛围和科研实力，且希望在未来能够在长三角地区发展，南京是一个不错的选择。南京的高校众多，选择范围广，能够满足不同学科的需求。
合肥：如果你更看重学校的整体实力和在安徽地区的认可度，且希望未来在安徽本地发展，合肥也是一个很好的选择。合肥工业大学的车辆、管理等领域具有明显优势，且就业率较高。
建议：
如果你对数学较为自信，英语相对较好，可以考虑南京航空航天大学或南京理工大学，这两所学校在控制学科方面实力较强，且专硕的招生要求相对较为宽松。
如果你对数学不太自信，但英语较好，可以考虑南京理工大学或合肥工业大学，这两所学校的专硕招生要求相对较为宽松，且在南京和合肥都有较好的就业前景。
如果你更看重学校的整体实力和地域优势，且希望未来在安徽本地发展，合肥工业大学是一个不错的选择。
最终的选择还需根据个人的兴趣、专业背景和职业规划来决定。建议多了解各学校的具体招生信息、专业设置和就业情况，以便做出更为明智的选择。