城市轨道交通运营管理考研可以选择的专业方向主要包括工商管理（专业硕士）。以下是一些建议的考研学校：
北京交通大学：
作为国内著名的交通大学之一，北京交通大学的轨道交通运营管理专业在学术研究和实际应用方面都有很高的声誉。学校拥有丰富的教学资源和师资力量，能够为学生提供良好的学习环境和实践机会。
西南交通大学：
西南交通大学的轨道交通运营管理专业同样具有很高的学术水平和行业影响力。学校在铁路工程、交通规划与管理等领域有着深厚的学术积淀，能够为学生提供全面的知识体系和实践能力。
兰州交通大学：
兰州交通大学在轨道交通运营管理专业方面也有着较好的教学和研究实力。学校注重实践教学，与多家地铁公司有着紧密的合作关系，能够为学生提供丰富的实习和就业机会。
大连交通大学：
大连交通大学的轨道交通运营管理专业在东北地区具有很高的知名度。学校在铁路运输、交通规划等方面有着丰富的教学经验和研究成果，能够为学生提供扎实的专业知识和技能。
广州大学机械与电气工程学院：
广州大学的交通运输专业在考研方面也有很好的表现。学院提供多种研究方向，包括交通运输、电子信息和自动化等，能够满足不同学生的兴趣和需求。
在选择学校时，建议综合考虑学校的学术声誉、师资力量、教学资源和实习机会等方面。同时，建议关注各学校的招生简章和专业目录，了解具体的考试科目和录取要求，以便更好地制定备考计划。