自动化专业考研可以选择以下学校：
哈尔滨工业大学：
国内著名高校，航天学院控制科学与工程学科硕士招生简介中排名第一，获得A+评价。电气自动化专业办学历史悠久，是很好的专业选择。
浙江大学：
综合实力和学术声誉都非常出色，位列全国高校前列。工科专业在国内外都有很高的知名度，尤其是自动化专业。
清华大学：
"211工程"、"985工程"、"世界一流大学和一流学科"重点建设高校，在自动化专业方面拥有较高的声誉和一流的学科实力。
上海交通大学：
在自动化专业方面具有很高的实力和声誉，拥有优秀的师资力量和良好的教学环境。
北京航空航天大学：
前身是北京航空学院飞机设备系，自动化科学与电气工程学院在自动化领域有深厚的研究背景和丰富的资源。
北京理工大学：
在自动化专业方面也有很好的表现，适合考研。
东北大学：
机械工程与自动化学院包涵机械结构、设备及系统的设计、制造、控制等多个学科领域，是一个集人才培养、科学研究和产品开发于一体的教学科研实体。
华中科技大学：
国家级特色专业，自动化专业在就业方向上比较广泛，毕业后可以在多个领域从事系统分析、系统设计、系统运行等工作。
西安交通大学：
虽然地处西北内地，但科研实力和历史底蕴强大，自动化专业也备受推荐。
武汉大学：
自动化学院在自动化领域有较高的声誉。
南京大学：
包括南京理工大学和南京航空航天大学，这些学校在自动化专业方面也有很好的表现和招生名额。
这些学校都是在自动化专业领域具有较高声誉和实力的院校，可以根据个人兴趣、研究方向和地理位置等因素进行选择。建议进一步了解各学校的具体招生情况和专业特点，以便做出更合适的选择。