杭州和重庆的考研难度各有特点，具体哪个更难需要根据个人的目标、专业偏好、竞争情况等因素来综合考虑。以下是一些具体的比较：
竞争激烈程度
杭州：
杭州师范大学等学校的学科数学等专业复试线考试难度相对较低，报考人数也较少，相对较为容易。
浙江大学作为国内顶级高校，考研难度在国内能排前5，竞争非常激烈。
重庆：
重庆师范大学等学校的竞争相对较小，但报考人数较多。
重庆大学作为中央直管、教育部直属的高校，考研难度也较大，特别是通信类专业竞争激烈，不接受调剂。
专业课难度
杭州：
杭州师范大学等学校的专业课相对基础，容易备考。
浙江大学的专业课难度较高，尤其是数学和通信类专业。
重庆：
重庆师范大学等学校的专业课相对较少，只有信号与系统一门。
重庆大学的专业课较多，且难度较高，尤其是通信类专业的数一英一和专业课内容。
地域优势
杭州：
杭州位于东部沿海，地理位置优越，有长三角城市群的加持，就业和发展前景较好。
重庆：
重庆位于西南腹地，近年来发展潜力逐步提升，特别是成渝城市圈的加持，就业和发展前景也不错。
建议
如果你更看重竞争相对较小和专业课较基础的学校，可以选择杭州的师范大学，如杭州师范大学。
如果你更看重学科优势和专业课较少且竞争激烈的高校，可以选择重庆的大学，如重庆大学，尤其是通信类专业。
如果你对地域没有特别偏好，且希望报考国内顶级高校，可以考虑浙江大学，尽管其考研难度较大。
最终选择哪个城市进行考研，还需要结合个人的实际情况和目标进行综合考虑。