在南京考研可以选择以下学校：
南京大学：
位于南京市玄武区，是江苏省内最著名的大学之一，设有研究生院，提供多种研究生专业进行报考。
东南大学：
位于南京市玄武区，是江苏省内另一所著名大学，设有研究生院，提供多种研究生专业进行报考。
南京航空航天大学：
位于南京市江宁区，是江苏省内一所知名高校，设有研究生院，提供多种研究生专业进行报考。
南京理工大学：
位于南京市玄武区，是隶属于中华人民共和国工业和信息化部的全国重点大学，设有研究生院。
河海大学：
位于南京市鼓楼区，是一所以水利为特色，工科为主，多学科协调发展的全国重点大学，设有研究生院。
南京农业大学：
位于南京市玄武区，是一所以农业和生命科学为优势和特色的全国重点大学，设有研究生院。
中国药科大学：
位于南京市玄武区，是一所以药学为特色，多学科协调发展的全国重点大学，设有研究生院。
南京师范大学：
位于南京市玄武区，是江苏省内著名的师范类大学，设有研究生院。
南京工业大学：
位于南京市江宁区，是一所以工科为主，多学科协调发展的省属重点大学，设有研究生院。
南京邮电大学：
位于南京市江宁区，是一所以信息科学为特色，多学科协调发展的全国重点大学，设有研究生院。
南京林业大学：
位于南京市玄武区，是一所以林业为特色，多学科协调发展的全国重点大学，设有研究生院。
南京信息工程大学：
位于南京市玄武区，是一所以大气科学为特色，多学科协调发展的全国重点大学，设有研究生院。
南京医科大学：
位于南京市玄武区，是一所以医学为特色，多学科协调发展的全国重点大学，设有研究生院。
南京中医药大学：
位于南京市玄武区，是一所以中医药为特色，多学科协调发展的全国重点大学，设有研究生院。
建议根据个人兴趣和专业方向选择合适的院校进行报考。例如，如果报考文科类专业，南京大学和南京师范大学的文学类专业全国认可度较高，但竞争也可能较大。