民办本科考研的缺点主要包括以下几个方面：
保研率低：
民办三本大学的保研率相对较低，与985和211高校相比差距较大。这使得民办本科学生在考研时需要付出更多的努力，以弥补这一方面的不足。
学习基础薄弱：
通过高考进入民办大学的学生，在学习能力、整体素养和知识结构方面与公办学校或层次更好的学生相比存在明显差距。这种学习基础的不足可能会影响他们在考研中的表现。
学术资源和科研平台不完善：
民办大学通常以教学为主，缺乏科研能力，也没有博士站等科研平台，这使得学生在考研的科研部分可能会处于劣势。
学习环境和氛围较差：
民办高校的学习环境和学习资源有限，学生可能缺乏学习动力和自律性，难以形成良好的学习氛围。相比之下，双一流高校的学习氛围更为浓厚，学生之间的互相支持和鼓励对考研成功有很大帮助。
面试歧视：
在考研的面试环节，民办本科学生可能会面临一定的歧视，尤其是当报考的学校层次较高时。这种歧视可能会影响他们的面试成绩，从而影响最终录取结果。
学科基础薄弱和自学习题：
由于民办大学在本科阶段的教学内容可能不够深入，学生在考研时需要自学大量课程以弥补这一不足。此外，面试中的专业问题也可能因为学科基础薄弱而难以应对。
综上所述，民办本科学生在考研过程中面临多方面的挑战，包括学习基础薄弱、缺乏科研资源、学习环境和氛围较差，以及面试中可能遭遇的歧视等。为了提高考研成功率，这些学生需要付出更多的努力和时间，同时寻找更多的学习资源和辅导机会。