高校限制考研的原因是多方面的，以下是一些主要的考虑：
教育质量担忧
随着研究生招生规模的扩大，研究生教育质量下降的担忧日益增加。一些人认为，限制二本及以下学生考研可以提高研究生生源质量，从而提升研究生教育水平。然而，这种观点忽视了个体差异和发展潜力，也与教育公平的理念相悖。
社会流动性问题
高等教育被视为促进社会流动的重要途径。限制二本及以下学生考研，实际上是在阻断这一重要的上升通道，不利于社会公平，也可能加剧社会分层，增加社会矛盾。
资源分配不均
限制二本及以下学生考研可能会影响这些学生的学习积极性，降低这些院校的吸引力，导致教育资源进一步向高层次院校集中，加剧教育资源分配的不均衡。
政策调整
政府可能对高等教育政策进行调整，要求学校调整研究生招生规模。政策变化可能是为了更好地适应就业需求和提高研究生就业率，促进产学研结合等目标。
专业设置与资格
有些专业可能没有设置硕士招生点，没有资格进行招生，因此不能考研。这些专业往往没有足够的师资力量，或者水平达不到，所以不能招生，更没有权力发放学历证书。
就业市场压力
大学生就业难是表面现象，实际上许多大厂处于缺人状态。限制二本生考研可能会促进缓解大学生的就业问题，减轻学生们的考研压力，提升考研上岸率。
提升研究生素质
高校考研改革的意图是提高研究生的素质，而不是限制考研报考条件。双非生不一定不如985/211学生，仅仅以高考成绩直接限制考研资格是不公平的。
公平原则
禁止二本考研不仅违背了公平原则，也限制了人才的发展。考研是一项公平竞争的机会，任何具备学术能力和兴趣的学生都应该有平等的机会去追求更高的学术水平。
综上所述，高校限制考研的原因复杂多样，涉及教育质量、社会公平、资源分配、政策调整等多个方面。然而，这些限制措施也可能带来一些负面影响，如剥夺了部分学生的发展机会，加剧了教育资源的不平等分配，以及违背了教育公平的原则。因此，在制定和执行此类政策时，需要综合考虑各种因素，确保政策的合理性和公平性。