考研时，南京大学和复旦大学都被认为是非常公平的，具体表现如下：
南京大学
保护一志愿考生：南京大学在考研中非常保护一志愿考生，不接受校外调剂，初试分数高复试的问题不大。
复试比例：初试与复试比例为1:1.2，初试只看专业课和英语成绩。
公平性：复试过程公开透明，没有明显的歧视现象。
复旦大学
不歧视双非考生：复旦大学在复试中不歧视双非考生，保护考生的第一志愿。
复试形式：部分专业没有笔试，只有面试，流程简单快捷，一般1-3天出结果。
公平性：整体复试过程公平公正，给分合理，不压分。
建议
选择学校：如果你是一志愿考生，且希望有更高的保护性，南京大学可能更适合你。如果你对某个专业特别感兴趣，且希望复试过程简洁高效，复旦大学可能更符合你的需求。
准备充分：无论选择哪所学校，都需要提前准备，尤其是专业课和英语，以应对初试的高难度。
关注信息：关注学校的官方网站和考研论坛，获取最新的招生信息和复试安排，以便做好充分的准备。
总体来说，南京大学和复旦大学在考研方面都非常公平，但具体选择哪所学校还需根据个人情况和职业规划来决定。